Судмедекспертиза активно застосовується у галузі кримінального та цивільного діловодства. Переважно вона призначається для обстеження трупів, обвинувачених, постраждалих та речових доків.
Обов'язкове призначення судово-медичної експертизи живих осіб проводиться для визначення характеру та ступеня шкоди, заподіяної здоров'ю (ст. 196 КПК України). Судово-медична експертиза живих осіб проводиться щодо постанови посадових осіб, які ведуть слідство, або за ухвалою суду.
Для визначення ступеня тяжкості завданих тілесних ушкоджень потерпілим у ДТП призначається судмедекспертиза (СМЕ). Від поставлених судмедексперту питань та результатів досліджень залежить визначення провини та караності особи, яка вчинила ДТП, або встановлення причини смерті внаслідок аварії.
Ким призначається судово-медична експертиза та в якому порядку? Як будь-яка експертиза, вона призначається правоохоронними органами. Тобто працівниками прокуратури, органів МВС, ФСБ чи суду, а також дізнання з винесенням постанови чи ухвали суду про призначенні експертизи.