Прийом метотрексату необхідно поєднувати з прийомом фолієвої кислоти для зменшення ризику розвитку побічних ефектів.
Під час терапії із застосуванням метотрексату пацієнту не слід приймати полівітамінні препарати або інші біологічно активні добавки, які містять фолієву кислоту, нестероїдні протизапальні препарати (НПЗП) або інгібітори протонного насоса (наприклад омепразол), за винятком випадків, коли такі препарати не можуть бути …
Виводиться переважно нирками у незміненому вигляді шляхом клубочкової фільтрації та канальцевої секреції (при в/в введенні 80-90% виводиться впродовж 24 год), з жовчю виводиться до 10% (з подальшою реабсорбцією у кишечнику). Метотрексат кумулює в печінці, нирках і органах протягом кількох тижнів або місяців.