Біоматеріалом служить кал, що здається у стерильному контейнері, бажано до початку медикаментозної терапії. ПЛР-тест за короткий період дозволить визначити природу діареї та основних її збудників. Дослідження слід проводити у першу добу від початку захворювання.
Посів на збудників кишкової інфекції (сальмонели, шигели) з визначенням чутливості до антибіотиків, мазок із прямої кишки
посів калу для визначення причинних бактерій та їх чутливості до антибіотиків; бактеріологічний посів вмісту блювання; загальноклінічний аналіз крові; копрологічний аналіз калу.